More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11480 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1448  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.24 
 
 		 555 aa  663    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  79.14 
 
 		 558 aa  890    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.06 
 
 		 559 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0674  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 555 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 		 555 aa  681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1352  ABC transporter related protein  83.57 
 
 		 560 aa  918    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000271939  hitchhiker  0.0000279927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2552  ABC transporter-like protein  73.26 
 
 		 554 aa  829    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1816  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.54 
 
 		 559 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.461866  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1855  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.21 
 
 		 559 aa  875    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1089  ABC transporter related protein  83.04 
 
 		 560 aa  933    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24710  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  80.54 
 
 		 560 aa  911    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0377191  normal  0.041371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0931  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.25 
 
 		 560 aa  921    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.4 
 
 		 557 aa  841    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3872  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.89 
 
 		 555 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0797074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.44 
 
 		 557 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.61 
 
 		 557 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4264  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.25 
 
 		 554 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.89 
 
 		 553 aa  651    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11480  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 560 aa  1148    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.19 
 
 		 547 aa  818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4832  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.218638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1329  ABC transporter related protein  74.69 
 
 		 554 aa  841    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.461505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3489  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 555 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1129  ABC transporter, ATP-binding protein YjiK  76.39 
 
 		 558 aa  876    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12501  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.18 
 
 		 558 aa  845    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0036999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2568  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.8 
 
 		 557 aa  835    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.878611  normal  0.580087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  75.22 
 
 		 557 aa  842    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1687  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.93 
 
 		 557 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00296418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4875  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 554 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0706  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.483075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.46 
 
 		 561 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.18 
 
 		 560 aa  966    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4905  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.25 
 
 		 555 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4993  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4939  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 559 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0762  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.04 
 
 		 555 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5309  ABC transporter related protein  56.79 
 
 		 559 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1403  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 		 556 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.595923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2580  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.17 
 
 		 560 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.471915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3678  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 555 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2152  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 556 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.21 
 
 		 559 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.51 
 
 		 561 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7358  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.3 
 
 		 554 aa  812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 555 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1148  putative ABC transporter ATP-binding protein  72.5 
 
 		 560 aa  824    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.493052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.96 
 
 		 553 aa  659    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 		 559 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4641  ABC transporter related protein  73.98 
 
 		 558 aa  846    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310211  hitchhiker  0.00496143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 558 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0705  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08900  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.46 
 
 		 560 aa  957    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210485  normal  0.0113448 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10980  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.11 
 
 		 558 aa  842    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.51 
 
 		 561 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1801  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 		 553 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.124805  normal  0.0665876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00997  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  56.35 
 
 		 555 aa  642    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.45 
 
 		 558 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.64 
 
 		 561 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.71 
 
 		 553 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1442  putative ABC transporter ATP-binding protein  76.25 
 
 		 559 aa  868    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.465539  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0300  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.57 
 
 		 559 aa  851    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.208774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.01 
 
 		 670 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 705 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.4 
 
 		 557 aa  841    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2642  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.75 
 
 		 560 aa  936    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 559 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3618  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 555 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09750  putative ABC transporter ATP-binding protein  85.36 
 
 		 560 aa  971    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.44 
 
 		 558 aa  838    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.610631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.21 
 
 		 554 aa  667    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3542  putative ABC transporter ATP-binding protein  81.61 
 
 		 558 aa  921    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5318  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 		 560 aa  822    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134924  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7359  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.51 
 
 		 554 aa  841    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2098  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.04 
 
 		 555 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5235  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 579 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2026  ABC transporter related protein  77.54 
 
 		 557 aa  863    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4991  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 555 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40960  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.5 
 
 		 554 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 554 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2418  putative ABC transporter ATP-binding protein  84.64 
 
 		 560 aa  960    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 555 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.82 
 
 		 560 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 561 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.08 
 
 		 558 aa  832    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.426446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004402  ABC transporter ATP-binding protein  56.96 
 
 		 555 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485845  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1614  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.61 
 
 		 556 aa  816    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.682319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.91 
 
 		 559 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1522  ABC transporter related protein  72.32 
 
 		 556 aa  818    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1127  putative ABC transporter ATP-binding protein  77.72 
 
 		 558 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1369  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.96 
 
 		 560 aa  820    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4510  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 		 555 aa  643    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.4 
 
 		 557 aa  841    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22290  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.29 
 
 		 559 aa  842    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.793295  normal  0.525138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4070  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.18 
 
 		 557 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 		 553 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>