More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  100 
 
 		 483 aa  926    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  48.2 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  46.94 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  44.23 
 
 		 486 aa  299  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  40.66 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  38.66 
 
 		 484 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  41.65 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  46.12 
 
 		 498 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 479 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 479 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  41.39 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  39.37 
 
 		 492 aa  246  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  40.86 
 
 		 509 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  39.65 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  40.06 
 
 		 493 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  42.42 
 
 		 497 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  39.47 
 
 		 484 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  34.88 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  38.11 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 483 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  35.57 
 
 		 464 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  35.25 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  39.24 
 
 		 488 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  35.53 
 
 		 490 aa  220  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  36.82 
 
 		 486 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  33.69 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  35.17 
 
 		 487 aa  217  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  31.95 
 
 		 474 aa  207  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  35.52 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  32.16 
 
 		 481 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  35.75 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  35.13 
 
 		 485 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  33.02 
 
 		 504 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  33.03 
 
 		 527 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  31.98 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000963226  hitchhiker  0.000000000995055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  32.86 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  33.16 
 
 		 507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 469 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 491 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 501 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 497 aa  94  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 		 475 aa  90.5  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  26.91 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 495 aa  87.4  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  26.52 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 521 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  26.17 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  27.33 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  22.76 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.24 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 502 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  27.65 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  22.51 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  24.32 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  28.38 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  28.96 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  26.51 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  26.7 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  23.96 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  28.97 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  22.69 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1698  amino acid permease-associated region  30.17 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.471872  normal  0.470522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  22.44 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>