More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7050 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  87.69 
 
 		 132 aa  236  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  86.92 
 
 		 130 aa  236  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  86.92 
 
 		 132 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  86.92 
 
 		 130 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  86.92 
 
 		 132 aa  235  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  84.62 
 
 		 132 aa  228  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  51.91 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  46.97 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  40.77 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2243  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2774  Endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1735  hypothetical protein  43.28 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  40.6 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  41.67 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  41.67 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  38.64 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3748  Endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  38.64 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  38.64 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3764  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  40.6 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  45.95 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  40.6 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  40.34 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  44.14 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  44.14 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  43.24 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  45.54 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  39.5 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  39.5 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  43.24 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3176  endoribonuclease L-PSP  38.97 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  43.36 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  40.87 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  47.92 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3087  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  45.83 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1109  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  40.91 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  46.79 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  42.71 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  42.71 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  34.35 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  41.67 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  40.18 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>