More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6917 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
463 aa  908    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  43.76 
 
 
455 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  43.81 
 
 
455 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  44.05 
 
 
455 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  44.05 
 
 
455 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  41.52 
 
 
455 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  41.52 
 
 
455 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.69 
 
 
457 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.69 
 
 
457 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.69 
 
 
457 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.69 
 
 
457 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.69 
 
 
457 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  43.69 
 
 
457 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  43.93 
 
 
457 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.45 
 
 
457 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  43.37 
 
 
455 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  44.47 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.75 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  38.49 
 
 
459 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  40.68 
 
 
480 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  40.52 
 
 
464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
485 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  39.47 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  41.03 
 
 
457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  39.29 
 
 
488 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  41.2 
 
 
473 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  43.44 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  40.38 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  42.42 
 
 
480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  40.38 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  40.14 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  40.14 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  40.14 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  40.14 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  40.14 
 
 
457 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  40.33 
 
 
457 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  40.38 
 
 
455 aa  299  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  40.38 
 
 
455 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  40.38 
 
 
455 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.39 
 
 
459 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
455 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  41.32 
 
 
498 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  41.19 
 
 
476 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  40.31 
 
 
475 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.1 
 
 
455 aa  289  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  41.81 
 
 
491 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  40.82 
 
 
466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  38.8 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  40.74 
 
 
472 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  41.61 
 
 
453 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  41.61 
 
 
453 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
455 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  39.01 
 
 
490 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  41.29 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  41.81 
 
 
497 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  39.43 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
468 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 
469 aa  260  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 
459 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  37.42 
 
 
468 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  41.71 
 
 
468 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
476 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  35.88 
 
 
474 aa  243  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  36.95 
 
 
479 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  36.95 
 
 
479 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  36.88 
 
 
463 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 
477 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.1 
 
 
500 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
481 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 
483 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.1 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 
465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 
477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 
482 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
475 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 
528 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 
540 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
461 aa  186  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 
456 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 
493 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 
478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 
486 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 
505 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 
512 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 
522 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 
457 aa  177  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27 
 
 
482 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 
522 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
524 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.13 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 
583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 
529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.84 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.47 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 
646 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>