More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6974 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6974  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 
337 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6316  glycoside hydrolase family 3 protein  97.63 
 
 
337 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.398008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1513  glycoside hydrolase family protein  97.22 
 
 
288 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6973  glycoside hydrolase family 3 protein  43.24 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1096  glycoside hydrolase family 3 protein  44.17 
 
 
333 aa  209  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340288  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6315  glycoside hydrolase family 3 protein  43.24 
 
 
346 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.636822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1514  glycoside hydrolase family protein  43.11 
 
 
379 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  34.74 
 
 
589 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  36.28 
 
 
966 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.06 
 
 
520 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.88 
 
 
582 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.2 
 
 
420 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.75 
 
 
575 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  31.78 
 
 
538 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.33 
 
 
492 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.32 
 
 
537 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.23 
 
 
594 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.64 
 
 
534 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.6 
 
 
361 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.84 
 
 
511 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.64 
 
 
534 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.25 
 
 
583 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.96 
 
 
427 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  36.46 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.75 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  37.09 
 
 
575 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  28.71 
 
 
543 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.53 
 
 
591 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 
543 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  37.09 
 
 
468 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.84 
 
 
484 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  33.81 
 
 
631 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.6 
 
 
573 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 
386 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 
552 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01728  beta-hexosaminidase  34.86 
 
 
361 aa  92.8  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.93 
 
 
503 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.02 
 
 
580 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  30.7 
 
 
592 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
444 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.05 
 
 
403 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  34.74 
 
 
624 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.14 
 
 
414 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.6 
 
 
528 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  31.34 
 
 
542 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.92 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  34.83 
 
 
656 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2567  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 
367 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.946372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.96 
 
 
698 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.55 
 
 
375 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.73 
 
 
543 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1221  glycosy hydrolase family protein  27.2 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  29.52 
 
 
923 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  34.76 
 
 
552 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  28.24 
 
 
544 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  34.4 
 
 
604 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  33.16 
 
 
557 aa  86.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4322  putative Beta-hexosaminidase  28.68 
 
 
476 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127427  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  28.89 
 
 
992 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  28.24 
 
 
544 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 
530 aa  86.3  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.55 
 
 
596 aa  85.9  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.64 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.85 
 
 
600 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  26.92 
 
 
971 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.25 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.47 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.76 
 
 
426 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.72 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  31.94 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.22 
 
 
976 aa  83.2  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.61 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  24.37 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  32.3 
 
 
585 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  31.15 
 
 
429 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.88 
 
 
403 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.56 
 
 
504 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.86 
 
 
568 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  30.67 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.91 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  34.91 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  29.52 
 
 
1007 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08060  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.97 
 
 
540 aa  79.3  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000859864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  25.25 
 
 
531 aa  79.3  0.00000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3777  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 
408 aa  79.3  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0155235  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  30.82 
 
 
538 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  30.1 
 
 
997 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.66 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.17 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.39 
 
 
482 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.43 
 
 
990 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  22.55 
 
 
845 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  24.63 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.19 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.56 
 
 
618 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  28.7 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  28.1 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  33.33 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>