284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2562 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  100 
 
 
201 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  99 
 
 
201 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  99 
 
 
201 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  93.4 
 
 
200 aa  339  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  87.88 
 
 
204 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  87.82 
 
 
201 aa  316  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  87.88 
 
 
204 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  67.69 
 
 
201 aa  260  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  65.05 
 
 
201 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  65.05 
 
 
201 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  64.52 
 
 
201 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  64.52 
 
 
201 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  64.52 
 
 
201 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  64.52 
 
 
201 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  50.77 
 
 
196 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  51.28 
 
 
196 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  51.02 
 
 
196 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  51.52 
 
 
202 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 
551 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  36.23 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  32 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.21 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  32.64 
 
 
575 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  36 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
305 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  30.67 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  29.83 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.62 
 
 
1287 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  25.63 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  24.35 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
364 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  34.06 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  37.14 
 
 
400 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.95 
 
 
259 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  43.94 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3129  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0588283  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  32.64 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  36 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
560 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  27.03 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
212 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 
284 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4927  Methyltransferase type 12  36.84 
 
 
218 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  0.017224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  30.72 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 
289 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
227 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  31.25 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2004  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.388226  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.54 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
291 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  31.37 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  37.89 
 
 
540 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
256 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.35 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  37 
 
 
522 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 
214 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
270 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
270 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
200 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
270 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
239 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  35.16 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  33 
 
 
535 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  32.82 
 
 
464 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  28.89 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  28.89 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
207 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.91 
 
 
224 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  36.54 
 
 
410 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  34.31 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  24.81 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.62 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  29.29 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
307 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.17 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  36.67 
 
 
238 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
221 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
222 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>