More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0459 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0459  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0938  methylmalonyl-CoA decarboxylase  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0900  methylmalonyl-CoA decarboxylase  97.76 
 
 		 269 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4040  methylmalonyl-CoA decarboxylase  95.15 
 
 		 269 aa  501  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.642217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2996  methylmalonyl-CoA decarboxylase  67.8 
 
 		 266 aa  345  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1611  methylmalonyl-CoA decarboxylase  45.24 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  41.47 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  40.7 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3534  methylmalonyl-CoA decarboxylase  42.4 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2461  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.89 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000140768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02750  methylmalonyl-CoA decarboxylase, biotin-independent  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4215  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3246  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0791  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02713  hypothetical protein  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3055  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3077  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3341  methylmalonyl-CoA decarboxylase  38.4 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1378  methylmalonyl-CoA decarboxylase  37.3 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3742  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2805  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3799  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0645207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3883  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0303551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5164  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.730416  normal  0.349871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4033  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67925  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.87 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  26.42 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0577  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  28.96 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.27 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0124  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  32.45 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.69 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.32 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  34.82 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.32 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.55 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  27.61 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.32 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1256  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 		 258 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  31.91 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.78 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3860  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  32.3 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  32.39 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  29.74 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7116  short chain enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262766  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.01 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  35.29 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  32.08 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.74 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>