69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5966 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 349 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 244 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  98.36 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  90.7 
 
 		 264 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  91.32 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  90.5 
 
 		 244 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  82.64 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  76.15 
 
 		 243 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  76.15 
 
 		 243 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  75.31 
 
 		 243 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  71.31 
 
 		 250 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  68.85 
 
 		 273 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  66.67 
 
 		 245 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  66.67 
 
 		 277 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  65.29 
 
 		 247 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  64.29 
 
 		 248 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  62.24 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  48.58 
 
 		 269 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  51.79 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  47.32 
 
 		 207 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  46.02 
 
 		 238 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  41.94 
 
 		 237 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  38.33 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 		 266 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.39 
 
 		 223 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.56 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  24.56 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 277 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 265 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 282 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  28.67 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 269 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  29.71 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  26.46 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.77 
 
 		 269 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  28.5 
 
 		 276 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  27.46 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  29.8 
 
 		 283 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  25.13 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.83 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  23.38 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  23.38 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.37 
 
 		 751 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  24.43 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 255 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  24.33 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  23.11 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 277 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>