More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3181 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3181  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 348 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  52.68 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2691  transcriptional regulator, LacI family  53.98 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0601  transcriptional regulator, LacI family  49.6 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0564  transcriptional regulator, LacI family  42.05 
 
 		 414 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.432352  normal  0.0264238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4271  transcriptional regulator, LacI family  45.14 
 
 		 349 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35310  transcriptional regulator, LacI family  36.89 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263381  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4919  transcriptional regulator, LacI family  37.82 
 
 		 358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3061  transcriptional regulator, LacI family  39.77 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13608  LacI family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.86 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.14 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 366 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.55 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  38.91 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.75 
 
 		 366 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2718  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.204137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1737  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.000686199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1526  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1633  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.88 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.65 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3807  LacI family transcription regulator  36.95 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0659508  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2909  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  26.67 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.420519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.24 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  31.02 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1521  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6308  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  35.78 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6966  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.51 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.29 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 346 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  31.53 
 
 		 355 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3821  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02629  Transcriptional regulator  28.66 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  27.55 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  30.38 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  31.37 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0485  transcriptional repressor, LacI family  31.52 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  31.74 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  35.51 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  31.48 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  25.7 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0233  regulatory protein LacI  28.96 
 
 		 349 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0302  sugar-binding protein, putative  31.89 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0278  putative sugar-binding protein  31.89 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  32.34 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2939  alanine racemase  30.84 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3991  transcriptional regulator, LacI family protein  29.1 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.05 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  25.8 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.41 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4696  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.57 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  25.89 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  28.95 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  32.04 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1207  alanine racemase  29.53 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  27.76 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  24.85 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  30.95 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.43 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3700  LacI family transcription regulator  26.22 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3122  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>