More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2718 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2718  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 354 aa  703    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.204137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  46.57 
 
 		 367 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4919  transcriptional regulator, LacI family  43.68 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35310  transcriptional regulator, LacI family  43.1 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263381  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  41.36 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  41.36 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  42.94 
 
 		 362 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  42.34 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.28 
 
 		 366 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.28 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13608  LacI family transcriptional regulator  40 
 
 		 404 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1521  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6966  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6308  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  38.98 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  38.7 
 
 		 353 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  38.73 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  40.11 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  37.47 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.21 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3821  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.33 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1737  LacI family transcription regulator  30.14 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.000686199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1633  LacI family transcription regulator  30.14 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1526  LacI family transcription regulator  30.14 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02629  Transcriptional regulator  32.63 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3991  transcriptional regulator, LacI family protein  32.82 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2691  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  31.22 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0061  LacI family transcription regulator  32.53 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000329359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0065  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000194735 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0063  LacI family transcription regulator  32.53 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367552 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  31.48 
 
 		 358 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0601  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3181  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3807  LacI family transcription regulator  37.85 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0659508  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.12 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0064  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.12 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0065  LacI family transcription regulator  31.12 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259026 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.36 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3061  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 323 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.69 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0564  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 414 aa  125  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.432352  normal  0.0264238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  32.87 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  33.24 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  32.21 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2909  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  27.98 
 
 		 365 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.420519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  26.74 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  29.54 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.42 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0354  transcriptional regulator, LacI family  31.22 
 
 		 342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  28.57 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0386  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.58 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.46 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.84 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1943  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 347 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  31.3 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  30.11 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  32.96 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  31.69 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  30.25 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  31.92 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  29.3 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  29.2 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  31.02 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  29.92 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0783  transcriptional regulator repressor  29.36 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  31.51 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  32.32 
 
 		 384 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.02 
 
 		 348 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  28.18 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  32.32 
 
 		 352 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  30.62 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  29.75 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  33.9 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>