More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5317 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 366 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  90.98 
 
 		 365 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  83.06 
 
 		 366 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  83.06 
 
 		 366 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  82.51 
 
 		 366 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13608  LacI family transcriptional regulator  79.06 
 
 		 404 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  57.53 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35310  transcriptional regulator, LacI family  54.52 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263381  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4919  transcriptional regulator, LacI family  51.51 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  43.49 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  43.72 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2718  transcriptional regulator, LacI family  40.28 
 
 		 354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.204137 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  39.64 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  39.55 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1521  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6308  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6966  LacI family transcription regulator  35.68 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1737  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.000686199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1633  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1526  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.47 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02629  Transcriptional regulator  32.64 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3991  transcriptional regulator, LacI family protein  32.43 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00173292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0065  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.25 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0064  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0060  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.25 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0061  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 342 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000329359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3181  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0063  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000367552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0065  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000194735 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  32.94 
 
 		 353 aa  142  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2691  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  32.79 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3821  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2909  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  28.83 
 
 		 365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.420519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3807  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 350 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0659508  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0601  transcriptional regulator, LacI family  34.37 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4271  transcriptional regulator, LacI family  35.2 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0564  transcriptional regulator, LacI family  28.01 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.432352  normal  0.0264238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3061  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3762  LacI family transcription regulator  32.48 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  29.38 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4446  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.95 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  29.25 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  24.59 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  24.38 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1046  regulatory protein, LacI  27.12 
 
 		 357 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  26.65 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  29.12 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.23 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.78 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  28.8 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.89 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1347  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2029  HTH-type transcriptional repressor  31.1 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.169196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  26.5 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.2 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  29.76 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  26.35 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  30.98 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  32.37 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  30.98 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  30.85 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0471  LacI family transcription regulator  32.86 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0818961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  27.42 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.84 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.84 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.14 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  26.91 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.84 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 332 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.84 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  30 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0082  transcriptional regulator, LacI family  29.58 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>