More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0601 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0601  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 379 aa  729    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.115964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07700  transcriptional regulator  63.2 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.241125  normal  0.0525574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2691  transcriptional regulator, LacI family  56.65 
 
 		 355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0564  transcriptional regulator, LacI family  46.02 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.432352  normal  0.0264238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3181  transcriptional regulator, LacI family  48.79 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4271  transcriptional regulator, LacI family  43.55 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1479  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4919  transcriptional regulator, LacI family  34.67 
 
 		 358 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0144  LacI family transcription regulator  38.17 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  37.07 
 
 		 350 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0346  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3061  transcriptional regulator, LacI family  36.73 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.111004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35310  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263381  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0196  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.56 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2243  LacI family transcription regulator  36.27 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.72 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2718  transcriptional regulator, LacI family  33.07 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.204137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4716  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4802  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  34.73 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2982  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 353 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000384304  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5101  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  32.3 
 
 		 358 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.63 
 
 		 366 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13608  LacI family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1312  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  28.61 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  32.01 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  34.13 
 
 		 336 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  30.67 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1521  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6308  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6966  LacI family transcription regulator  31.48 
 
 		 365 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  33.88 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.29 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1537  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.87 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3911  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.363783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.98 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  33.78 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4340  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.11 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  33.33 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3623  transcriptional regulator, LacI family  33.69 
 
 		 354 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  33.77 
 
 		 330 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.67 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.2 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.03 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  25.89 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  30.51 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4766  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.97 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.51 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  31.13 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.27 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  29.02 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  34.29 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  32.03 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.71 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.71 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 360 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.46 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3700  LacI family transcription regulator  26.59 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  30.25 
 
 		 338 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.5 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  29.5 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.5 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.5 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  29.5 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.5 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.5 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  30.83 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.5 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.45 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.7 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.81 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.48 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  30.16 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1397  LacI family transcription regulator  27.63 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4363  LacI family transcription regulator  30.73 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000162438  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  32.78 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.55 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2199  LacI family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.585531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.29 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  27.85 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>