More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1016 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  61.27 
 
 		 212 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  49.01 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  43.52 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  45.27 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  46.8 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  45.19 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  46.53 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  43.63 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  48.02 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  39.19 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  45.32 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  46.89 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  42.16 
 
 		 193 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 		 193 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.05 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  38.12 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  38.08 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  38.42 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  37.93 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  37.93 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  36.45 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  46.94 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  34.93 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  35.96 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  34.83 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  39.9 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  32.91 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  39.73 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.08 
 
 		 356 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  34.92 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.5 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  31.51 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.17 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.85 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  25.5 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  34.09 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.2 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.63 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.21 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  31.38 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.23 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  31.38 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  31.38 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  31.38 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>