More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0918 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0918  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 349 aa  684    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  44.06 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  42.94 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  41.33 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  37.57 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.16 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  37.03 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  36.21 
 
 		 352 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.99 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  37.04 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  37.36 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.34 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.01 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.77 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.34 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  36.71 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.18 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.04 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.04 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.04 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  34.06 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.07 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  35.98 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  34.77 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.6 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  38.84 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.3 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.92 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  31.3 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.2 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  34.1 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.67 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  31.81 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.53 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.24 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.81 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.5 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 344 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.48 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.45 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  36.13 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  34.84 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  33.8 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  33.22 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.49 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  36.88 
 
 		 346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  31.27 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  32.66 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.24 
 
 		 331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  32.66 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.25 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  33.95 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  29.07 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.28 
 
 		 353 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 337 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  33.43 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.32 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 335 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.43 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.86 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.78 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.43 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.43 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.43 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.98 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>