More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5075 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  89.18 
 
 		 425 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  91.4 
 
 		 423 aa  776    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  97.44 
 
 		 430 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  852    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  91.4 
 
 		 423 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  88.7 
 
 		 368 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  50.58 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  53.04 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  53.28 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  53.28 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  53.03 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  49.3 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.26 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.47 
 
 		 433 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 439 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.95 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 460 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 460 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 431 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  31.31 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.88 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 436 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.81 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  29.93 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 438 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  29.38 
 
 		 441 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  30.05 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  30.05 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  29.38 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  30.05 
 
 		 432 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  29.38 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  29.38 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  27.99 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  30.89 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  30.89 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  30.89 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  30.49 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 436 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 447 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 447 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.63 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  30.63 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  29.11 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  29.11 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  29.11 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  29.11 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  29.62 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  29.11 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  29.11 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  29.11 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  28.54 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  30.12 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  29.4 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 447 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>