More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4071 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  95.82 
 
 		 311 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  87.82 
 
 		 312 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  87.82 
 
 		 312 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  87.18 
 
 		 312 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  87.42 
 
 		 307 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  86.77 
 
 		 303 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  70.66 
 
 		 317 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  70.03 
 
 		 317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  70.03 
 
 		 317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  70.35 
 
 		 317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  70.03 
 
 		 317 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  70.25 
 
 		 316 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  64.63 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  63.42 
 
 		 321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  50.68 
 
 		 590 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  50.17 
 
 		 592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  48.32 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  47.65 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  47.16 
 
 		 595 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  47.65 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 		 595 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 		 595 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 		 595 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  45.11 
 
 		 618 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  45.74 
 
 		 595 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 		 595 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  47.75 
 
 		 596 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  47.4 
 
 		 596 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  47.4 
 
 		 596 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  47.4 
 
 		 596 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  46.81 
 
 		 602 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  46.79 
 
 		 602 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  47.65 
 
 		 340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  46.81 
 
 		 590 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  45.05 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  46.37 
 
 		 568 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 		 315 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 602 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  40.67 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 588 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  33.55 
 
 		 750 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 		 592 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 588 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 588 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 588 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  44.03 
 
 		 543 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 538 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 		 289 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  36.41 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  37.95 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  37.35 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  33.93 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  36.69 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.6 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.48 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.94 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  23.3 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>