More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4511 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  75.97 
 
 
518 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  74.69 
 
 
530 aa  684    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  75.97 
 
 
518 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  75.97 
 
 
518 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  74.69 
 
 
530 aa  684    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.22 
 
 
519 aa  922    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  76.16 
 
 
518 aa  717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.98 
 
 
519 aa  862    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.38 
 
 
519 aa  932    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  74.69 
 
 
530 aa  684    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
519 aa  1036    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.99 
 
 
519 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.23 
 
 
519 aa  1030    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  94.99 
 
 
519 aa  929    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.28 
 
 
514 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.53 
 
 
608 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.53 
 
 
608 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.12 
 
 
542 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.864566 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  53.67 
 
 
600 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 
513 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.67 
 
 
605 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 
570 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.95 
 
 
588 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  49.9 
 
 
513 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  51.46 
 
 
616 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.56 
 
 
601 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  50.1 
 
 
515 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  48.83 
 
 
608 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.44 
 
 
595 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.66 
 
 
615 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.66 
 
 
615 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.06 
 
 
634 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  50.87 
 
 
621 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  50.87 
 
 
626 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 
538 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
588 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 
524 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 
588 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 
588 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.29 
 
 
587 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 
612 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 
596 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 
542 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 
617 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
521 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
522 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
522 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.64 
 
 
655 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.64 
 
 
648 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 
618 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.79 
 
 
648 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 
659 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.29 
 
 
587 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.75 
 
 
589 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 
549 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
659 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
659 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
657 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.91 
 
 
597 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.1 
 
 
673 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.17 
 
 
516 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  47.3 
 
 
673 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  47.1 
 
 
671 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.91 
 
 
673 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.91 
 
 
673 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.91 
 
 
673 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.91 
 
 
673 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 
549 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.22 
 
 
532 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
555 aa  346  6e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  47.3 
 
 
666 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  59.63 
 
 
551 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
535 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.8 
 
 
566 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 
572 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  54.55 
 
 
513 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.64 
 
 
553 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  45.73 
 
 
553 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.04 
 
 
553 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 
520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.04 
 
 
553 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 
520 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.04 
 
 
553 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 
579 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 
557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
547 aa  336  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  43.47 
 
 
547 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
583 aa  336  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.47 
 
 
547 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.47 
 
 
547 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  41.9 
 
 
557 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.9 
 
 
557 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 
541 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.83 
 
 
556 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
562 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5735  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
510 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0480332  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.5 
 
 
547 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.08 
 
 
547 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  42.97 
 
 
557 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>