More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3215 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  88.94 
 
 		 425 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  90.7 
 
 		 423 aa  767    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  97.44 
 
 		 430 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  90.7 
 
 		 423 aa  767    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  88.12 
 
 		 368 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  52.9 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  53.04 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  52.8 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.41 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  50.74 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  48.35 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.68 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  49.4 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.98 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.75 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.21 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 435 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 439 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  30.41 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 433 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  31.41 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  31.41 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  31.41 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  31.16 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  30.9 
 
 		 428 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  30.77 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 426 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 436 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  29.43 
 
 		 458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 447 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  29.48 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  29.8 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  29.8 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  29.8 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  27.99 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.89 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  27.51 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  28.89 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 444 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  28.24 
 
 		 430 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  28.24 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  28.24 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  28.24 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  28.24 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  28.24 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  28.75 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  28.24 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  29.88 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>