More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0184 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 648 aa  1283    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.85 
 
 		 597 aa  673    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  80.5 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  80.69 
 
 		 673 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  80.69 
 
 		 671 aa  759    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.02 
 
 		 655 aa  1020    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.03 
 
 		 659 aa  954    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  80.89 
 
 		 673 aa  761    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  80.38 
 
 		 666 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.71 
 
 		 618 aa  737    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  80.5 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.24 
 
 		 659 aa  952    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.99 
 
 		 648 aa  1117    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.24 
 
 		 659 aa  952    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.26 
 
 		 657 aa  959    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  80.5 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  80.5 
 
 		 673 aa  756    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.19 
 
 		 617 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.27 
 
 		 549 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 		 567 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 		 547 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.87 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  49.81 
 
 		 600 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.17 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.17 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.43 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.44 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 615 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.23 
 
 		 615 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 		 572 aa  389  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  48.28 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  43.24 
 
 		 608 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 		 605 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.99 
 
 		 595 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  67.28 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  49.14 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  48.96 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 		 588 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.27 
 
 		 601 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.98 
 
 		 519 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0431  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  49.15 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 		 538 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 		 566 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.68 
 
 		 634 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  48.68 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.25 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.55 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.03 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 		 570 aa  364  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 		 519 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.41 
 
 		 519 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.14 
 
 		 596 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 		 559 aa  362  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.41 
 
 		 519 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.41 
 
 		 519 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.95 
 
 		 540 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740725  normal  0.573307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.12 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.66 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000944533  normal  0.933191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.76 
 
 		 536 aa  360  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 		 555 aa  359  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.12 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 		 540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27960  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  42.91 
 
 		 575 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  65.29 
 
 		 557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  65.29 
 
 		 557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 		 557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.29 
 
 		 557 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.49 
 
 		 541 aa  356  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.93 
 
 		 573 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.97 
 
 		 601 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947036  normal  0.198959 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.52 
 
 		 588 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 		 579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  46.73 
 
 		 518 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  46.73 
 
 		 518 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  46.94 
 
 		 518 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  46.73 
 
 		 518 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.3 
 
 		 513 aa  353  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.99 
 
 		 524 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 		 521 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.89 
 
 		 556 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  44.24 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.53 
 
 		 567 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.28 
 
 		 594 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.35 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 561 aa  351  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 		 515 aa  350  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 		 576 aa  350  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 532 aa  349  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 		 574 aa  349  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>