More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0338 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  100 
 
 
433 aa  850    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  78.18 
 
 
460 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  76.94 
 
 
445 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  76.94 
 
 
445 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  77.7 
 
 
460 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  76.94 
 
 
445 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  76.4 
 
 
445 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  76.42 
 
 
445 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  64.27 
 
 
438 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  64.49 
 
 
438 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  48.36 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  47.69 
 
 
452 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  48.8 
 
 
452 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  50.82 
 
 
461 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.82 
 
 
437 aa  359  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  44.05 
 
 
468 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
440 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.76 
 
 
433 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 
461 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  42.82 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  42.82 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  42.82 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.91 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  48.93 
 
 
438 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  43.87 
 
 
443 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  42.56 
 
 
450 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.29 
 
 
442 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  42.19 
 
 
484 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  41.84 
 
 
459 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.07 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  43.24 
 
 
437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  41.72 
 
 
439 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.34 
 
 
437 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  45.75 
 
 
439 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  43.17 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 
446 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  43.17 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  43.17 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  43.67 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.93 
 
 
439 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.93 
 
 
439 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  42.68 
 
 
439 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  44.05 
 
 
442 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.09 
 
 
458 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  41.55 
 
 
456 aa  315  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.47 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  43.25 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  41.16 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  41.57 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
432 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
431 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.06 
 
 
455 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  41.4 
 
 
456 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  44.56 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  43.87 
 
 
455 aa  308  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  42.89 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  42.89 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  42.89 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  40.7 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  39.81 
 
 
459 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  39.34 
 
 
430 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  41.04 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  39.58 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  41.25 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  43.36 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.69 
 
 
439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  42.69 
 
 
439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 
437 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.18 
 
 
439 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.18 
 
 
439 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.71 
 
 
450 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  40.79 
 
 
454 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  39.95 
 
 
447 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  41.67 
 
 
435 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  40.88 
 
 
433 aa  299  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  40.66 
 
 
435 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  40.66 
 
 
435 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
443 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
443 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  41.41 
 
 
457 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
443 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
443 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
443 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  40.43 
 
 
435 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  39.9 
 
 
439 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2701  major facilitator family transporter  39.58 
 
 
443 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  41.04 
 
 
451 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  40.43 
 
 
434 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  40.19 
 
 
435 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  40.19 
 
 
435 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  42.22 
 
 
441 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 
435 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2645  major facilitator superfamily permease  39.34 
 
 
443 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  40.33 
 
 
439 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  40.14 
 
 
441 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  39.68 
 
 
457 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  43.13 
 
 
439 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.68 
 
 
457 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  38.34 
 
 
463 aa  292  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.68 
 
 
457 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>