122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_5089 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  99.1 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  99.1 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  99.1 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  98.65 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  95.52 
 
 		 223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  95.07 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87.89 
 
 		 223 aa  410  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  82.96 
 
 		 223 aa  390  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  83.86 
 
 		 223 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.66 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  43.89 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  42.99 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  42.99 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  45.32 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  44.83 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  44.83 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  44.83 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  44.33 
 
 		 219 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  35.09 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  34.21 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.77 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.77 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.77 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 223 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  33.86 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  27.03 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  27.48 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  28.77 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  29.35 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.51 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  26.8 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0396  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.67 
 
 		 348 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.58 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1723  cyclic nucleotide-binding  30.86 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.3 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1785  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.06 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.9 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  19.9 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.83 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  18.85 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3749  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.9168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  32.81 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.41 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.28 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.9 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  18.85 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.8 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.47 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  18.93 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  18.32 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  24.44 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  18.32 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.92 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  19.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.02 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>