198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1138 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
484 aa  961    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  85.12 
 
 
484 aa  812    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  95.66 
 
 
464 aa  876    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  49.07 
 
 
487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  44.79 
 
 
490 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  43.6 
 
 
456 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  42.68 
 
 
493 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  42.3 
 
 
486 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  37.63 
 
 
484 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  41.06 
 
 
495 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  43.33 
 
 
485 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  42.09 
 
 
486 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  39.96 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  40.04 
 
 
495 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  43.09 
 
 
472 aa  310  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  40.45 
 
 
487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  39.67 
 
 
489 aa  306  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  40.04 
 
 
487 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  39.01 
 
 
483 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  30.36 
 
 
485 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  25 
 
 
452 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  27.58 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.68 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  28.82 
 
 
623 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  27.66 
 
 
623 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  28.26 
 
 
481 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  29.43 
 
 
587 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
613 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  31.4 
 
 
588 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 
481 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  28.29 
 
 
623 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  29.91 
 
 
632 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 
482 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.93 
 
 
626 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 
632 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 
632 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  27.52 
 
 
619 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.82 
 
 
622 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
476 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.1 
 
 
727 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  28.61 
 
 
588 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
485 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 
627 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  23.34 
 
 
475 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 
818 aa  87  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.74 
 
 
640 aa  86.7  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  25.3 
 
 
611 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  28.66 
 
 
585 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  27.55 
 
 
618 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  24.43 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.24 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  26.85 
 
 
623 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  22.97 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  24.7 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  23.39 
 
 
456 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  23.33 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  22.46 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  27.1 
 
 
624 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  27.1 
 
 
624 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
858 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.44 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
858 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  21.32 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.35 
 
 
623 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  29.44 
 
 
660 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  21.23 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22.05 
 
 
489 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.21 
 
 
704 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 
623 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 
847 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
667 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  28.12 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.55 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 
667 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  26.7 
 
 
637 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  27.02 
 
 
697 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
560 aa  65.1  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  25.75 
 
 
680 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  21.54 
 
 
568 aa  64.7  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  26.76 
 
 
643 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  26.76 
 
 
643 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  23.22 
 
 
457 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  26.76 
 
 
643 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  23.8 
 
 
846 aa  64.3  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  22.6 
 
 
531 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  23.03 
 
 
626 aa  63.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  27.23 
 
 
665 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  27.23 
 
 
665 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  21.83 
 
 
537 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  26.57 
 
 
659 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  21.4 
 
 
486 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  23.83 
 
 
838 aa  60.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>