More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0930 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  99.74 
 
 
392 aa  780    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  100 
 
 
392 aa  783    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  81.25 
 
 
386 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  59.01 
 
 
388 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  56.66 
 
 
387 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  54.5 
 
 
405 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  53.02 
 
 
382 aa  395  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  56.2 
 
 
402 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  53.7 
 
 
388 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  47.76 
 
 
390 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  50.66 
 
 
424 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  45.99 
 
 
390 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  51.72 
 
 
399 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  47.35 
 
 
400 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  49.2 
 
 
390 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  45.93 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.87 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  46.51 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  49.61 
 
 
387 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  46.51 
 
 
391 aa  276  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  46.63 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  47.34 
 
 
388 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  48.86 
 
 
390 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  43.31 
 
 
393 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  45.6 
 
 
390 aa  262  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.23 
 
 
385 aa  249  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  42.01 
 
 
387 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.05 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  43.24 
 
 
392 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.75 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  39.7 
 
 
377 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.28 
 
 
402 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  38.14 
 
 
386 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.4 
 
 
533 aa  225  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  42.11 
 
 
381 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  35.46 
 
 
492 aa  223  4e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  40.78 
 
 
394 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.82 
 
 
388 aa  220  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  38.46 
 
 
1143 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  34.99 
 
 
392 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  42.6 
 
 
373 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  38.32 
 
 
404 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.9 
 
 
396 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  45.69 
 
 
388 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  44.3 
 
 
368 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  35.31 
 
 
401 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  35.51 
 
 
388 aa  217  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  35.77 
 
 
386 aa  216  5e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  35.82 
 
 
401 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  36.79 
 
 
394 aa  216  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  36.68 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.9 
 
 
1139 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  37.6 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  35.31 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  34.82 
 
 
384 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  43.08 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  40.26 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  36.62 
 
 
397 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  41.58 
 
 
381 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  35.86 
 
 
384 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  35.75 
 
 
382 aa  210  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  35.92 
 
 
398 aa  209  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  38.34 
 
 
399 aa  209  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  36.79 
 
 
398 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  41.6 
 
 
379 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  36.76 
 
 
493 aa  208  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  35.26 
 
 
401 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.06 
 
 
400 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.27 
 
 
379 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  38.06 
 
 
400 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  38.18 
 
 
387 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  34.2 
 
 
384 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  37.66 
 
 
388 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  35.11 
 
 
409 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3724  Cysteine desulfurase  41.94 
 
 
384 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252129  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  37.11 
 
 
399 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  38.54 
 
 
385 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  34.47 
 
 
401 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  34.11 
 
 
394 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  36.29 
 
 
398 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  34.47 
 
 
401 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  33.16 
 
 
382 aa  203  4e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  36.86 
 
 
389 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.53 
 
 
389 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  35.81 
 
 
396 aa  203  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3207  Cysteine desulfurase  36.79 
 
 
380 aa  203  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  34.87 
 
 
398 aa  202  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  34.29 
 
 
398 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  35.14 
 
 
398 aa  202  8e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  35.23 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  37.07 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  37.14 
 
 
407 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  37.24 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  35.16 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  34.73 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  36.43 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  38.44 
 
 
402 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  38.3 
 
 
1135 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  37.11 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  38.97 
 
 
408 aa  199  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>