234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7241 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 599 aa  1166    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  53.56 
 
 		 618 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  42.41 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  42 
 
 		 623 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  42.41 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  42.72 
 
 		 627 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  41.52 
 
 		 632 aa  360  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  41.22 
 
 		 623 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  33.59 
 
 		 623 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  33.59 
 
 		 623 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  34.08 
 
 		 613 aa  242  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  31.78 
 
 		 623 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  30.24 
 
 		 619 aa  220  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  32.45 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.5 
 
 		 611 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  30.48 
 
 		 622 aa  208  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 		 548 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.52 
 
 		 727 aa  102  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  27.01 
 
 		 487 aa  97.4  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 637 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.9 
 
 		 690 aa  94.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  27.74 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  27.74 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  27.74 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 547 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 583 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  27.03 
 
 		 547 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  27.74 
 
 		 547 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 546 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  27.74 
 
 		 547 aa  92  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 		 547 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.07 
 
 		 920 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 631 aa  89  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  26.36 
 
 		 639 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 588 aa  87.8  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 		 484 aa  87.4  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  27.92 
 
 		 626 aa  87  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  27.48 
 
 		 645 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  26.3 
 
 		 641 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  28.43 
 
 		 640 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25.91 
 
 		 685 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  26.73 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  26.13 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 631 aa  83.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.15 
 
 		 623 aa  83.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 568 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  26.73 
 
 		 644 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  26.18 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 624 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 624 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  25.76 
 
 		 641 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  25.5 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  22.7 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.3 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 640 aa  80.1  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  23.67 
 
 		 630 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 		 697 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  25.45 
 
 		 641 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 		 846 aa  79.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1877  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 641 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  25.9 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  28.04 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  28.64 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  28.95 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  29.36 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 		 715 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 		 672 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  26.89 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 		 660 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 		 683 aa  76.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.96 
 
 		 818 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  23.45 
 
 		 637 aa  75.5  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.03 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  25.91 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  24.09 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>