230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7204 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  100 
 
 		 400 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  51.38 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  51.39 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  52.09 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  52.09 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  51.53 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  51.62 
 
 		 413 aa  362  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  50.97 
 
 		 399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  49.35 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  50.7 
 
 		 399 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  46.45 
 
 		 399 aa  311  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  43.22 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  43 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  40.81 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  43.68 
 
 		 394 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  43.09 
 
 		 394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  42.82 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  39.69 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  41.52 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  42.39 
 
 		 394 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.16 
 
 		 399 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  42.31 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  42.31 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  42.05 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  43.85 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  38.42 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  41.76 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.61 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.23 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  37.33 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  35.73 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  40.78 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  39.89 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  35.45 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  34.93 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  39.03 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  37.14 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  34.48 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  34.57 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  34.57 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  34.57 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  34.31 
 
 		 416 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  35.04 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  34.21 
 
 		 421 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  33.95 
 
 		 421 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  34.21 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  33.95 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  33.95 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  31.33 
 
 		 409 aa  199  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  36.43 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  34.08 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  31.69 
 
 		 464 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.25 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  30.62 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  32.73 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  30.62 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  33.61 
 
 		 403 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  30.37 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  30.37 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  30.37 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  30.37 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  30.37 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  30.5 
 
 		 445 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  30.12 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  32.04 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  30.18 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  33.52 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.04 
 
 		 411 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  32.55 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  30.08 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.47 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  31.83 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  31.31 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.33 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.65 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  31.2 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  31.2 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  31.33 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  30.39 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  30.95 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  30.95 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  30.95 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  30.02 
 
 		 422 aa  149  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  31.02 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  30.79 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.66 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  29.31 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.66 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  30.71 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.42 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.42 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  30.47 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  30.71 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.31 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  30.71 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.31 
 
 		 413 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  30.43 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.17 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  32.76 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  30.05 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>