245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6030 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  100 
 
 
329 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  74.38 
 
 
330 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  74.69 
 
 
330 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  75.42 
 
 
334 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  74.51 
 
 
334 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  74.59 
 
 
329 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  73.15 
 
 
329 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  74.84 
 
 
326 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  73.29 
 
 
326 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  73.29 
 
 
326 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  73.55 
 
 
328 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  68.2 
 
 
332 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  66.67 
 
 
326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  67.75 
 
 
323 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  63.03 
 
 
323 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  62.31 
 
 
336 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.18 
 
 
335 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  63.47 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  39.38 
 
 
343 aa  242  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  36.31 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  36.05 
 
 
382 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  36.87 
 
 
361 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  38.36 
 
 
359 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  36.07 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  36.4 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  34.49 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  35.36 
 
 
324 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  32.75 
 
 
338 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  31.56 
 
 
342 aa  136  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  31.56 
 
 
342 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  29.08 
 
 
674 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
915 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  31.1 
 
 
375 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.09 
 
 
1065 aa  102  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  26.69 
 
 
686 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.03 
 
 
1075 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  28.74 
 
 
778 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  27.45 
 
 
330 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  28.91 
 
 
856 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.92 
 
 
1238 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  29.26 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 
1004 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  33.47 
 
 
327 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.65 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  25.97 
 
 
821 aa  92.8  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1004 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.86 
 
 
314 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  28.29 
 
 
311 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.23 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  31.3 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  28.98 
 
 
775 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  29.8 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  30.2 
 
 
360 aa  89  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  29.41 
 
 
327 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  29.04 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  29.04 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.45 
 
 
328 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.55 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.88 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.41 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.04 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.48 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.92 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.04 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  29.78 
 
 
342 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.68 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.68 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.57 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  27.59 
 
 
593 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.68 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.68 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  29.88 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.31 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  27.47 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  25.62 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.36 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  28.27 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.11 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  27.92 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  26.25 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  29.37 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.85 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.85 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.27 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  32.85 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  32.85 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  32.85 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  32.85 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.85 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.85 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.87 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  25.94 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.12 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.2 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  23.86 
 
 
721 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.19 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.12 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.19 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.86 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>