59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6014 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6014  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383358  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  49.09 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 910 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  44.83 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 833 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 895 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  37.7 
 
 		 900 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4232  LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4755  LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  26.39 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3737  LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354722  normal  0.0596552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 940 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0856  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4858  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  43.75 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5426  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967948  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  43.4 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  44.83 
 
 		 919 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 		 940 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  35.71 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 876 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  35.71 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3508  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.581522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  44.23 
 
 		 937 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  35.71 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  44.23 
 
 		 937 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 937 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 959 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  40 
 
 		 961 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 879 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 220 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  34.52 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 938 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 		 367 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.33 
 
 		 894 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  39.44 
 
 		 921 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 927 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.29 
 
 		 913 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  34.04 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.36 
 
 		 917 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 897 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 824 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 950 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>