More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3667 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  72.81 
 
 		 217 aa  307  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0030  two component LuxR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1157  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  38.39 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  37.74 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 241 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  40.19 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141427  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  38.36 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  39.53 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4627  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.527017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  39.46 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  32.39 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  37.74 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  36.79 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  36.15 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  35.85 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  38.35 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  37.86 
 
 		 214 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  36.19 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  36.19 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  35.71 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  35.71 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5459  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953036  normal  0.183697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3543  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4824  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.63 
 
 		 232 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4205  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4728  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3779  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  31.34 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  30.88 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  32.72 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  30.88 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  30.88 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  31.02 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 246 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  31.37 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>