More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4606 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
377 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  73.14 
 
 
377 aa  554  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  72.27 
 
 
378 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  73.07 
 
 
389 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  70.56 
 
 
377 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  71.69 
 
 
380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  73.64 
 
 
384 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  45.9 
 
 
416 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  42.9 
 
 
387 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 
419 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 
419 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 
397 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  39.63 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  39.63 
 
 
389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  44.24 
 
 
375 aa  266  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
389 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  44.75 
 
 
399 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  38.98 
 
 
378 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
376 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  29.56 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
407 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
415 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
391 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.56 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  24.56 
 
 
366 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  24.56 
 
 
366 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  24.56 
 
 
366 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.56 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  25.09 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
377 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
414 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
689 aa  85.9  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  27.37 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
304 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  22.22 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28.43 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.31 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.13 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.06 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.94 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
750 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  24.57 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.94 
 
 
369 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.19 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.23 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.44 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
822 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 
400 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  25.08 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
435 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.65 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23 
 
 
745 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  23.48 
 
 
743 aa  76.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.02 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.87 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  30.77 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>