85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2995 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2995  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6646  ANTAR domain protein with unknown sensor  52.79 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274077  normal  0.0846161 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5693  ANTAR domain protein with unknown sensor  52.79 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0468503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1304  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.25 
 
 		 206 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5906  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.06 
 
 		 206 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4420  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  49.25 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0050  response regulator receiver and ANTAR domain protein  50.26 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3637  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.82 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0573839  normal  0.0644959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4901  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.82 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.138975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0461  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.71 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.537058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5752  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36 
 
 		 216 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.320255  normal  0.798388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1847  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.6 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.871675  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2420  transcription antitermination protein, putative  38.34 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0802  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.52 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0673655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2207  ANTAR  36.84 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1767  aliphatic amidase regulator  34.2 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.43 
 
 		 194 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1952  putative aliphatic amidase regulator (AmiR)  41.1 
 
 		 148 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20590  aliphatic amidase regulator  31.69 
 
 		 196 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00237487  normal  0.77718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4597  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.48 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1754  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.83 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.299806  normal  0.0795607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3278  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.93 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  0.994762 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3259  transcription antitermination protein  31.44 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3991  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.44 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4296  ANTAR  28.42 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0466063 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6673  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.2 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0170316  normal  0.327107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.47 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.72 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.87 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  26.61 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  26.61 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.53 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.46 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3323  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.59 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.89 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5638  Response regulator antiterminator domain-containing protein  24.32 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0386912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  25 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.79 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  29.57 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.68 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.98 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.91 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  23.39 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  24.39 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2662  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.49 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.19 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.62 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  24.56 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.92 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.62 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.92 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.61 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  23.58 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.09 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.62 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.71 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.24 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.95 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.24 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  28.24 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  21.95 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  23.77 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.95 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  21.95 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  32.04 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.89 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  22.76 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.32 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.646198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.92 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.32 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.14 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  22.81 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.85 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0209  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.27 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.98 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.56 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  25.96 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.35 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3201  hypothetical protein  23.71 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.72 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>