52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2597 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  100 
 
 		 307 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  75.32 
 
 		 311 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  74.68 
 
 		 311 aa  454  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  74.35 
 
 		 311 aa  455  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  74.35 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  53.27 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  52.29 
 
 		 311 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  53.72 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  53.72 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  52.1 
 
 		 313 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  29.41 
 
 		 622 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 622 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  27.36 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  28.78 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  22.85 
 
 		 383 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  22.85 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  29.22 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  23.3 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  28.75 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  25.31 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.18 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  24.19 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  24.29 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  23.74 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  25.81 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  26.21 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  25.89 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  23.88 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.98 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  28.62 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  24.35 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  28.37 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  25.71 
 
 		 619 aa  70.1  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.34 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  24.04 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  23.77 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  25.5 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  20.92 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.59 
 
 		 590 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  22.06 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.8 
 
 		 603 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  18.68 
 
 		 526 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  22.77 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  22.58 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10156  ethanolamine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11550)  25.93 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.348276  normal  0.68664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  25 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  29.85 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  28.44 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  27.47 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  23.26 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>