295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_13130  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4114  hypothetical protein  65.25 
 
 
123 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4685  hypothetical protein  67.54 
 
 
120 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4420  hypothetical protein  62.3 
 
 
128 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  65.22 
 
 
119 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57490  hypothetical protein  65.22 
 
 
125 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4996  hypothetical protein  64.35 
 
 
125 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4400  hypothetical protein  56.52 
 
 
123 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.147019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4524  hypothetical protein  56.52 
 
 
123 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1324  hypothetical protein  55.65 
 
 
124 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294844  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0932  hypothetical protein  56.64 
 
 
123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0142  conserved hypothetical protein TIGR00252  47.41 
 
 
121 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0315  protein of unknown function UPF0102  47.41 
 
 
121 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  48.72 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0756  hypothetical protein  48.33 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0675  protein of unknown function UPF0102  43.8 
 
 
165 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0355  hypothetical protein  45.54 
 
 
124 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3065  hypothetical protein  41.03 
 
 
118 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1176  hypothetical protein  48.21 
 
 
122 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  45.38 
 
 
116 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  46.61 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04380  hypothetical protein  47.46 
 
 
122 aa  97.1  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0184  hypothetical protein  42.37 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0589  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424556  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4433  hypothetical protein  38.05 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1674  hypothetical protein  47.5 
 
 
121 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1748  hypothetical protein  47.5 
 
 
121 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3146  sigma-54 factor  42.86 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00890  hypothetical protein  39.83 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2213  protein of unknown function UPF0102  46.43 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004502  endonuclease  40.68 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000161677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0630  hypothetical protein  44.07 
 
 
144 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  46.94 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1908  hypothetical protein  44.64 
 
 
173 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102604  hitchhiker  0.00425538 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0259  hypothetical protein  36.75 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  36.75 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  33.61 
 
 
119 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1695  hypothetical protein  38.79 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  35.83 
 
 
118 aa  87  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3454  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3620  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3560  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3523  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.578592  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3452  hypothetical protein  41.67 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0497  hypothetical protein  38.76 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2198  hypothetical protein  44.34 
 
 
172 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00219221  decreased coverage  0.00807275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1639  hypothetical protein  45.9 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.106195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  84  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  31.67 
 
 
123 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  41.18 
 
 
123 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4337  hypothetical protein  42.15 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.977576  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3355  hypothetical protein  41.07 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0123  hypothetical protein  43.86 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  39.29 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  38.98 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0538  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3443  hypothetical protein  41.38 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0474  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1121  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0195  hypothetical protein  38.6 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2464  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03015  hypothetical protein  40.52 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0557  protein of unknown function UPF0102  40.52 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0550  hypothetical protein  40.52 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02966  hypothetical protein  40.52 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0197  hypothetical protein  44.63 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.404878  unclonable  0.00000000000559374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0272  hypothetical protein  39.29 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000600044  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0405  hypothetical protein  43.22 
 
 
154 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0503  hypothetical protein  39.47 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.451178 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  36.21 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3783  hypothetical protein  41.18 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00882109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3630  hypothetical protein  41.28 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1062  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  33.05 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  39.29 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  42.48 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4313  hypothetical protein  44.07 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3440  protein of unknown function UPF0102  46 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  34.19 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  39.64 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  39.47 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3694  hypothetical protein  34.55 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3624  hypothetical protein  41.28 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3265  hypothetical protein  42.98 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  37.07 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  37.93 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4467  hypothetical protein  40.37 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  41.88 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0739  hypothetical protein  37.72 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.235623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  32.77 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  38.95 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3625  hypothetical protein  39.47 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3135  hypothetical protein  40.52 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0112  hypothetical protein  39.29 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0388  hypothetical protein  36.61 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.597532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3766  hypothetical protein  37.7 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.969308  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  34.48 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  38.4 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3585  hypothetical protein  36.8 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.186326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>