More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  100 
 
 		 363 aa  720    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  75.92 
 
 		 365 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  74.79 
 
 		 365 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  75.35 
 
 		 365 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  74.57 
 
 		 366 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  73.43 
 
 		 367 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  72.02 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  72.29 
 
 		 367 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  74.22 
 
 		 365 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  71.14 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  70.29 
 
 		 364 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  53.54 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  50.99 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  51.12 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  49.15 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  47.91 
 
 		 363 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  47.91 
 
 		 363 aa  291  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  43.42 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  40.88 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  39.38 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  38.32 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  36.39 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  30.17 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  30.17 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  29.6 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  34.05 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  29.51 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  29.51 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.74 
 
 		 369 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  28.45 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  28.94 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.74 
 
 		 369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  36.8 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  35.58 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  35.58 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  30.56 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.83 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  32.25 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.96 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  31.82 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  29.89 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  29.63 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.1 
 
 		 374 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.68 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.63 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  29.63 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.63 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  29.37 
 
 		 371 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  29.57 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 373 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.17 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  29.63 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  29.1 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  29.1 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  32.54 
 
 		 402 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 		 371 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  31.45 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  29.5 
 
 		 439 aa  126  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  32.25 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.13 
 
 		 371 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  32.42 
 
 		 375 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  27.01 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  31.73 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  32.77 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  31.03 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  32.29 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  30.27 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 418 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.95 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  31.09 
 
 		 652 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.51 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  32.25 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  36.46 
 
 		 666 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.94 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  32.68 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.23 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.23 
 
 		 428 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.23 
 
 		 428 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  36.46 
 
 		 666 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.92 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.58 
 
 		 434 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.47 
 
 		 428 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  32.45 
 
 		 432 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  29.38 
 
 		 363 aa  116  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.34 
 
 		 434 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  31.44 
 
 		 652 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>