More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07860 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  61.11 
 
 
628 aa  789    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  100 
 
 
630 aa  1257    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  47.47 
 
 
627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  47.47 
 
 
641 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  45.92 
 
 
627 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  46.97 
 
 
623 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  46.25 
 
 
628 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.02 
 
 
1023 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  35.35 
 
 
616 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  35.02 
 
 
616 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  33.39 
 
 
614 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 
619 aa  277  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.13 
 
 
613 aa  274  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 
602 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.7 
 
 
619 aa  259  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 
612 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 
617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 
613 aa  254  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 
602 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 
627 aa  242  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
638 aa  239  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  29 
 
 
624 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
627 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
698 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28.64 
 
 
821 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 
628 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.64 
 
 
685 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.64 
 
 
685 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  28.48 
 
 
685 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.48 
 
 
685 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.48 
 
 
685 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  28.48 
 
 
685 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 
597 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.73 
 
 
614 aa  219  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.9 
 
 
614 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  29.52 
 
 
631 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.9 
 
 
614 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.58 
 
 
631 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  28.76 
 
 
680 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  27.61 
 
 
621 aa  217  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.73 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.73 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.73 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 
624 aa  216  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.59 
 
 
614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 
615 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.59 
 
 
614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.59 
 
 
614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 
617 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.42 
 
 
614 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.42 
 
 
614 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  28.08 
 
 
623 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.47 
 
 
645 aa  208  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
629 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.98 
 
 
631 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.55 
 
 
615 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  29.17 
 
 
622 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.19 
 
 
614 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
617 aa  204  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.87 
 
 
615 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.07 
 
 
623 aa  198  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.57 
 
 
631 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.97 
 
 
631 aa  197  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  29.08 
 
 
638 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 
593 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  28.34 
 
 
620 aa  191  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
611 aa  191  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.94 
 
 
616 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
648 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
697 aa  186  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.38 
 
 
630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 
634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  28.38 
 
 
630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
632 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
621 aa  181  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  25.73 
 
 
613 aa  180  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  26.41 
 
 
611 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  25.44 
 
 
617 aa  178  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  28.14 
 
 
646 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 
626 aa  177  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.2 
 
 
618 aa  176  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 
621 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 
735 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
642 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
642 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
642 aa  168  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
642 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3886  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 
642 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 
618 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
637 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 
695 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
642 aa  157  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
638 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 
634 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
692 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 
671 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
690 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>