More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7091 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7091  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 319 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5241  ABC transporter permease  47.3 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6137  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0504355  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7433  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  37.22 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5535  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  hitchhiker  0.00000782274 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4886  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4797  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.305461  normal  0.0281641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3647  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0606167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  37 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5993  putative branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  34.56 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329288  normal  0.170989 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1950  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2886  putative ABC transporter permiase component  36.92 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1097  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.701299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1828  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000769607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.72 
 
 		 609 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0851  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.589569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  32.26 
 
 		 616 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3398  inner-membrane translocator  27.34 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0288037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0908  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 338 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.579851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 344 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1929  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  31.02 
 
 		 603 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 357 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1500  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  36.3 
 
 		 590 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  35.44 
 
 		 589 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 315 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1906  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 326 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  29.53 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0143  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 571 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  35.44 
 
 		 589 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2301  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.281867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.72 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1602  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.47347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  28.78 
 
 		 562 aa  93.2  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3966  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  30.72 
 
 		 337 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  36.47 
 
 		 589 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3500  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 358 aa  92.4  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 347 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  26.24 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  31 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1140  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  31.77 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0634  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3688  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1850  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  30 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  30.88 
 
 		 594 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0828  inner-membrane translocator  30.31 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.51 
 
 		 594 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3553  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0351  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0132915  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  33.83 
 
 		 608 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 358 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5148  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  30.58 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1677  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0846907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_815  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  29.97 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.488573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1564  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1532  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 368 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.378741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1424  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  32.16 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.37 
 
 		 656 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>