91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6271 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  100 
 
 		 468 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  63.21 
 
 		 459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  61.48 
 
 		 459 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  57.44 
 
 		 453 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  53.76 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  50.91 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  47.72 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  40.59 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  37.14 
 
 		 483 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  34.15 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  37.05 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  30.15 
 
 		 482 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  27.65 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  26.18 
 
 		 453 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  27.84 
 
 		 474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  27.03 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  28.28 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  26.33 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  27.04 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  26.81 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.38 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  23.91 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.42 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  29.92 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  26.33 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  27.49 
 
 		 516 aa  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  28.09 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  27.91 
 
 		 508 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  26.02 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  29.35 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  25.27 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  23.87 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  23.87 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  29.35 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  29.35 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  23.87 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  29.35 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  23.87 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  27.41 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  29.35 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  23.87 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  29.35 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  22.47 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5317  carbohydrate kinase FGGY  23.08 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0709  carbohydrate kinase FGGY  26.47 
 
 		 498 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000641335  hitchhiker  0.0000000000000388436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  28.78 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  28.8 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  27.38 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  31.86 
 
 		 509 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3420  carbohydrate kinase FGGY  24.91 
 
 		 497 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.825828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  29.95 
 
 		 489 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  23.26 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  29.44 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  22.1 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  24.93 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2917  carbohydrate kinase FGGY  26.94 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  21.8 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  22.1 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  25.44 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  28.8 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  27.87 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  22.18 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0704  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  25.07 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  21.8 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  21.93 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  25.47 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  28.26 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  22.34 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  23.26 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  22.34 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  22.34 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.09 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  22.34 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  22.34 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  24.93 
 
 		 494 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  22.34 
 
 		 482 aa  44.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  22.92 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  25.1 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  22.34 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3317  carbohydrate kinase FGGY  24.33 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  22.65 
 
 		 490 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  31.4 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.94 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  31.4 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  26.34 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  30.58 
 
 		 641 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.59 
 
 		 498 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  36.27 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  25.23 
 
 		 485 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  31.4 
 
 		 537 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1685  carbohydrate kinase, FGGY  25.26 
 
 		 499 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>