More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5624 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.44 
 
 		 2750 aa  1136    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.8 
 
 		 2771 aa  1124    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  37.17 
 
 		 2531 aa  1395    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.63 
 
 		 2249 aa  728    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  49.06 
 
 		 1764 aa  896    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  43.75 
 
 		 1272 aa  983    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  41.58 
 
 		 2414 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.32 
 
 		 2694 aa  818    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  41.96 
 
 		 2764 aa  1127    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  47.18 
 
 		 2560 aa  841    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  37.71 
 
 		 2260 aa  885    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  44.41 
 
 		 2683 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  45.33 
 
 		 2664 aa  810    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  33.47 
 
 		 2674 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  48.17 
 
 		 1772 aa  890    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.75 
 
 		 2704 aa  823    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  46.91 
 
 		 2657 aa  814    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  46.65 
 
 		 2640 aa  810    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  100 
 
 		 2448 aa  4902    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  41.23 
 
 		 2620 aa  1138    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2840  beta-ketoacyl synthase  47.22 
 
 		 2624 aa  818    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  43.46 
 
 		 2266 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  46.39 
 
 		 2542 aa  794    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  45.22 
 
 		 2477 aa  734    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  44.93 
 
 		 2642 aa  821    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  45.12 
 
 		 2443 aa  719    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.75 
 
 		 2661 aa  1102    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.3 
 
 		 2300 aa  1036    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  44.72 
 
 		 2693 aa  820    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  44.03 
 
 		 2703 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  43.54 
 
 		 2298 aa  745    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  45.7 
 
 		 2619 aa  836    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  42.78 
 
 		 2189 aa  711    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  39.48 
 
 		 2503 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  39.86 
 
 		 2553 aa  570  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  38.81 
 
 		 2314 aa  563  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  39.67 
 
 		 2386 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  37.5 
 
 		 2327 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  38.26 
 
 		 2816 aa  516  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  38.72 
 
 		 2628 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.7 
 
 		 3243 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  35.68 
 
 		 2772 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  35.05 
 
 		 3115 aa  491  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  32.35 
 
 		 3008 aa  478  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  36.89 
 
 		 1631 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.11 
 
 		 2754 aa  429  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  34.38 
 
 		 2338 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.37 
 
 		 1656 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.99 
 
 		 3099 aa  386  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2697  beta-ketoacyl synthase  33.54 
 
 		 1923 aa  386  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393145  normal  0.42177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  32.57 
 
 		 1955 aa  383  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.42 
 
 		 2462 aa  383  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  32.87 
 
 		 2888 aa  377  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.3 
 
 		 1587 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 2551 aa  367  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  29.86 
 
 		 1087 aa  368  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6351  Erythronolide synthase  32.07 
 
 		 1985 aa  366  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  31.99 
 
 		 1929 aa  360  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  32.51 
 
 		 3693 aa  360  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  32.51 
 
 		 3693 aa  360  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  32.51 
 
 		 3702 aa  360  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 5400 aa  359  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 7110 aa  357  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  32.11 
 
 		 4080 aa  355  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  32.75 
 
 		 1935 aa  354  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 5154 aa  354  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.86 
 
 		 7210 aa  352  5e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 1837 aa  351  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 1874 aa  349  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  32.18 
 
 		 3676 aa  347  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.42 
 
 		 3696 aa  347  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.89 
 
 		 1984 aa  346  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 1816 aa  346  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  31.39 
 
 		 7279 aa  346  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.31 
 
 		 3679 aa  346  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  31.61 
 
 		 1740 aa  346  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  30.77 
 
 		 1413 aa  345  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 2376 aa  345  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  32.44 
 
 		 4575 aa  344  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  31.78 
 
 		 4840 aa  343  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  33.15 
 
 		 1453 aa  342  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  29.7 
 
 		 3158 aa  341  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  30.27 
 
 		 1939 aa  340  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 2374 aa  339  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.4 
 
 		 1372 aa  339  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  31.87 
 
 		 4478 aa  338  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  32.03 
 
 		 1908 aa  338  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  31.26 
 
 		 3930 aa  338  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  30.34 
 
 		 2066 aa  338  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.69 
 
 		 1349 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.36 
 
 		 1101 aa  337  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.8 
 
 		 1349 aa  337  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.46 
 
 		 1354 aa  335  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  30.79 
 
 		 4151 aa  335  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  30.35 
 
 		 1144 aa  334  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  30.52 
 
 		 3254 aa  334  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.61 
 
 		 1337 aa  332  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  31.99 
 
 		 2614 aa  332  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 		 1548 aa  330  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  31.21 
 
 		 2113 aa  330  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>