More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5328 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 391 aa  783    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.89 
 
 		 375 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0640  ABC transporter related  51.05 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1770  ABC transporter related  49.08 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0636101  decreased coverage  0.00357448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0132  ABC transporter related  49.87 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0177  ABC transporter related  49.87 
 
 		 385 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3148  ABC transporter related  48.68 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7593  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.55 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1669  ABC transporter related  48.82 
 
 		 392 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1183  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.37 
 
 		 392 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0969985  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1086  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 392 aa  312  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  45.69 
 
 		 361 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.95 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  45.69 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.25 
 
 		 332 aa  295  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.71 
 
 		 351 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  44.24 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  47.88 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 359 aa  293  5e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 363 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  46.59 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  49.56 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  42.33 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  43.39 
 
 		 385 aa  289  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 		 386 aa  289  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  45.38 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  44.65 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5670  ABC transporter related  56.27 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  44.7 
 
 		 371 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  43.08 
 
 		 363 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  52.29 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  44.65 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.33 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  43.51 
 
 		 372 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3171  ABC transporter related  44.44 
 
 		 354 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  44.87 
 
 		 370 aa  286  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  42.6 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  43.75 
 
 		 376 aa  285  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3347  ABC transporter related  45.9 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.79 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  42.39 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  42.39 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  43.8 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  45.24 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  46.27 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  45.64 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03901  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  47.72 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.96 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  48.41 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  44.19 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  42.86 
 
 		 392 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  43.83 
 
 		 368 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2280  ABC transporter related  41.03 
 
 		 413 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  44.15 
 
 		 332 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.04 
 
 		 386 aa  282  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  43.31 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  49.11 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  43.8 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  50.51 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  45.82 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2331  ABC transporter related  41.03 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.884473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  43.29 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  45.08 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  42.93 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  42.01 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  44.13 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  52.3 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  45.11 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  46.27 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  45.29 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  46.65 
 
 		 345 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  44.09 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  52.54 
 
 		 373 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  44.19 
 
 		 367 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  42.6 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 370 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  54.86 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  43.3 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  53.91 
 
 		 371 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  43.86 
 
 		 372 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.01 
 
 		 366 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  45.86 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.64 
 
 		 386 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  42.28 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  43.27 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  50.97 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  48.9 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>