More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2869 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2869  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
609 aa  1223    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367044  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
616 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344787 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5244  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 
584 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.553389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3799  methyl-accepting chemotaxis protein  39.02 
 
 
601 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1640  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 
600 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0736059  normal  0.0470065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0806  methyl-accepting chemotaxis protein  43.24 
 
 
842 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.36 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.756404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2928  methyl-accepting chemotaxis protein  41.13 
 
 
792 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4013  methyl-accepting chemotaxis protein  41.23 
 
 
756 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3923  methyl-accepting chemotaxis protein  40.45 
 
 
843 aa  271  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.12 
 
 
841 aa  269  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2608  methyl-accepting chemotaxis protein  36.85 
 
 
655 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.445883  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7643  sensory methylation accepting chemotaxis protein  49.03 
 
 
575 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 
698 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1208  methyl-accepting chemotaxis protein  37.63 
 
 
604 aa  266  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5092  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 
626 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359668  normal  0.0114189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2927  methyl-accepting chemotaxis protein  35.56 
 
 
730 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0257741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0452  methyl-accepting chemotaxis protein  41.85 
 
 
622 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 
843 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
843 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
615 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3647  methyl-accepting chemotaxis protein  40.59 
 
 
680 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  40.91 
 
 
653 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9088  methyl-accepting chemotaxis protein  43.01 
 
 
761 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.76 
 
 
665 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0972557  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0214  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
663 aa  260  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.287216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0994  methyl-accepting chemotaxis protein  42 
 
 
649 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0980  methyl-accepting chemotaxis protein  39.31 
 
 
611 aa  259  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.442512  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.48 
 
 
625 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.817515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3005  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 
665 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.59 
 
 
669 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3714  methyl-accepting chemotaxis protein  36.58 
 
 
679 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0885803  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  39.85 
 
 
776 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0996  methyl-accepting chemotaxis protein  44.42 
 
 
647 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  42.14 
 
 
778 aa  257  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
665 aa  257  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713215  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  40.24 
 
 
695 aa  256  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1117  methyl-accepting chemotaxis protein  37.16 
 
 
657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.593573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3729  methyl-accepting chemotaxis protein  40.59 
 
 
644 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.554142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 
615 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
677 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0125911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.85 
 
 
842 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507772  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.78 
 
 
785 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
661 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.66296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0640  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.43 
 
 
604 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122515  normal  0.297773 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4945  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 
635 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4811  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.75 
 
 
625 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.327513  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2952  sensory methylation accepting chemotaxis protein  47.83 
 
 
575 aa  250  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 
645 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.73856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
717 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0697  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 
610 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6402  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
688 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.579482  normal  0.320846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2791  methyl-accepting chemotaxis protein  45.82 
 
 
622 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.34 
 
 
603 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183078  normal  0.160096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
796 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000874578 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 
650 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375381  normal  0.0878449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
665 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4686  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.54 
 
 
601 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115608  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8025  sensory methylation accepting chemotaxis protein  45.12 
 
 
594 aa  244  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1159  methyl-accepting chemotaxis protein  36.09 
 
 
671 aa  244  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.573311  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 
605 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 
644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3811  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 
840 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.1 
 
 
605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 
599 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367406  normal  0.838811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
778 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0947231 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9076  methyl-accepting chemotaxis protein  36.12 
 
 
612 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1547  methyl-accepting chemotaxis protein  37.19 
 
 
635 aa  238  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0672502  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.92 
 
 
793 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
647 aa  236  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5166  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.12 
 
 
669 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 
660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105118  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
606 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440189  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4978  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 
846 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23325  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.77 
 
 
614 aa  234  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.311641  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 
509 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 
749 aa  233  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.726311  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0793  methyl-accepting chemotaxis protein  38.75 
 
 
740 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  37.32 
 
 
728 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 
602 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180362  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.47 
 
 
726 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.45 
 
 
592 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.377399 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
782 aa  229  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684679  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 
642 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.376796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0958  methyl-accepting chemotaxis protein  37.26 
 
 
610 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 
771 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 
494 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 
771 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.595827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0276  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
657 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461968  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 
615 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371991  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5165  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 
559 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2860  methyl-accepting chemotaxis protein  36.68 
 
 
668 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 
642 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 
627 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.727839  hitchhiker  0.0000148535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
636 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
615 aa  223  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1201  methyl-accepting chemotaxis protein  35.29 
 
 
728 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 
556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.9 
 
 
586 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 
648 aa  219  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.59059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>