More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2434 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  100 
 
 		 387 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  65.1 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  65.62 
 
 		 388 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  65.27 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  56.66 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  56.66 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  55.56 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  55.06 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  47.37 
 
 		 382 aa  351  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  52.28 
 
 		 424 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.89 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  52.89 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  53.42 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  53.16 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  48.68 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  48.81 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  50.53 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  50.66 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  46.81 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  47.62 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  50.66 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  48.95 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  49.33 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  45.65 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  46.54 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  39.27 
 
 		 378 aa  266  5e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  48.53 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  44.62 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  46.04 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.73 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  41.8 
 
 		 383 aa  252  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  37.22 
 
 		 398 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  41.67 
 
 		 385 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 533 aa  246  4e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.38 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  38.3 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  46.6 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.52 
 
 		 386 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 401 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  36.95 
 
 		 392 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  34.37 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  37.11 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  37.4 
 
 		 401 aa  239  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.73 
 
 		 396 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  37.96 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.39 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.92 
 
 		 384 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.11 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  36.19 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  41.3 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  37.14 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  43.34 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  43.42 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40.85 
 
 		 1143 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  36.06 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.14 
 
 		 403 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  44.71 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  42.17 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  40.89 
 
 		 1135 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 385 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  43.83 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.14 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  37.66 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  38.14 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.45 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  35.86 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  35.68 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 1139 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  38.68 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  37.88 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  37.88 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  44.41 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  40.54 
 
 		 399 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  39.38 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  37.56 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0304  rrf2/aminotransferase, class V family protein  35.03 
 
 		 530 aa  219  6e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  39.38 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  39.53 
 
 		 380 aa  219  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  43.34 
 
 		 381 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  38.27 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  42.37 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3724  Cysteine desulfurase  45.31 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252129  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  34.97 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  36.48 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  40.56 
 
 		 400 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  39.27 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2365  aminotransferase, class V  44.03 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.494188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  35.82 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  37.69 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  42.37 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  44.24 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  35.66 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  36.18 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  34.99 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  38.48 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  38.2 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  39.48 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>