More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3966 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3966  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 
202 aa  414  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.0175805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5027  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  74.13 
 
 
201 aa  333  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.162476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3629  isopropylmalate isomerase small subunit  61.54 
 
 
206 aa  283  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3761  isopropylmalate isomerase small subunit  62.05 
 
 
197 aa  280  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3810  isopropylmalate isomerase small subunit  62.05 
 
 
197 aa  280  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1327  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  61.73 
 
 
197 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.507856  normal  0.452578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2548  isopropylmalate isomerase small subunit  61.19 
 
 
202 aa  263  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0488432  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0871  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.37 
 
 
217 aa  221  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1621  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.56 
 
 
206 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03331  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.56 
 
 
206 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.52 
 
 
204 aa  214  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0321  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.76 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00352929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24681  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.31 
 
 
210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0643  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.47 
 
 
206 aa  211  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0900  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.51 
 
 
223 aa  209  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02771  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  45.92 
 
 
207 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.385201  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02781  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  47.98 
 
 
212 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0257  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.43 
 
 
207 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.420219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02881  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.43 
 
 
206 aa  200  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.130398  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.21 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2087  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  47.64 
 
 
204 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02811  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  48.68 
 
 
207 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2657  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.19 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2681  isopropylmalate isomerase small subunit  44.16 
 
 
201 aa  188  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1847  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  43.46 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1602  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.81 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0187865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0667  isopropylmalate isomerase small subunit  42.13 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1545  aconitate hydratase domain protein  43.94 
 
 
209 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.831045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  37.88 
 
 
201 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  37.37 
 
 
201 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  35.75 
 
 
201 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  36.87 
 
 
201 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  46.62 
 
 
204 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  36.87 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0627  isopropylmalate isomerase small subunit  37.27 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  36.87 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  35.64 
 
 
201 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.23 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.194299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  37.64 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  34.65 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  39.63 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  37.31 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  35.15 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  33.68 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  36.04 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4709  isopropylmalate isomerase small subunit  45.89 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  35.68 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4440  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.83 
 
 
196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  35.53 
 
 
200 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  43.71 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  35.26 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  37.36 
 
 
200 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  36.41 
 
 
201 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  36.73 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  36.73 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  37.11 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  35.05 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1246  isopropylmalate isomerase small subunit  40.65 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0186  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  32.98 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  35.35 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  33.67 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  35.5 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  36.04 
 
 
216 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  34.54 
 
 
201 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  33.67 
 
 
201 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
201 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
201 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  36.22 
 
 
201 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  35.03 
 
 
200 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  35.03 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  34.85 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  34.85 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  42.57 
 
 
209 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  37.36 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  35.6 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  36.08 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1173  isopropylmalate isomerase small subunit  37 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  36.08 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2131  isopropylmalate isomerase small subunit  45.07 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  36.78 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  36.78 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  34.52 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  35.57 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  35.57 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  35.53 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  35.42 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  31.96 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  36.04 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  35.53 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  34.03 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>