34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3181 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  100 
 
 
482 aa  994    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  57.51 
 
 
476 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  56.96 
 
 
477 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  30.2 
 
 
430 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.03 
 
 
482 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  23.7 
 
 
450 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.52 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.11 
 
 
412 aa  90.5  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.9 
 
 
877 aa  87  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  24.15 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  25.18 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  25.18 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  24.41 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  24.05 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.74 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  23.23 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  21.09 
 
 
464 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  22.14 
 
 
438 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  28.11 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  26.94 
 
 
433 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  28 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  24.87 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  29.76 
 
 
444 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  23.29 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  21.7 
 
 
393 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  26.74 
 
 
353 aa  53.5  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  32.18 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  44.64 
 
 
432 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  28.03 
 
 
495 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.08 
 
 
416 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  26.88 
 
 
313 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  21.51 
 
 
433 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  22.25 
 
 
461 aa  47  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.58 
 
 
371 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>