154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2378 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  272  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  63.97 
 
 
132 aa  169  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  56.73 
 
 
151 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  50 
 
 
121 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  55.56 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  56.12 
 
 
124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  72.31 
 
 
126 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  72.31 
 
 
126 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  56.41 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  53.75 
 
 
112 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  44 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  44.23 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  47.31 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  48.51 
 
 
108 aa  83.6  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  46.81 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  50.68 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10191  hypothetical protein  50.65 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  46.84 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10201  hypothetical protein  50.65 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  44.94 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  47.19 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  37.86 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  45.78 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  45.78 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  40.96 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  41.98 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  37.08 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  48.1 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  48.1 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  37.93 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37 
 
 
192 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  42.47 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  33.7 
 
 
188 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  46.58 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  44.19 
 
 
98 aa  59.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  34.15 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  39.76 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  43.02 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  30.08 
 
 
220 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  30.3 
 
 
191 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  34.29 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  39.74 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  36.36 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  34.94 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  31.03 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  34.12 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  28.43 
 
 
194 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  39.51 
 
 
201 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  30.84 
 
 
248 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  34.74 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  33.78 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  32.56 
 
 
191 aa  50.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  27.59 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  39.74 
 
 
190 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  34.94 
 
 
219 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  26.6 
 
 
192 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  30 
 
 
234 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  30.86 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  26.32 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  39.47 
 
 
230 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  32.56 
 
 
192 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  28.42 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  32.22 
 
 
201 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  28.89 
 
 
218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  27.66 
 
 
192 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  27.06 
 
 
190 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  37.66 
 
 
200 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  28.89 
 
 
190 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  28.89 
 
 
190 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  31.58 
 
 
192 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  38.71 
 
 
188 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  27.78 
 
 
218 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  27.66 
 
 
192 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  30.77 
 
 
190 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  30.49 
 
 
188 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  38.75 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  34.09 
 
 
199 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  36.36 
 
 
195 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  28.12 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  36.05 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  33.75 
 
 
190 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  28.4 
 
 
203 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  36.46 
 
 
213 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  35.92 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  30.56 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  27.78 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  27.78 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>