205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1567 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  48.11 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  39.62 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  45.19 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  45.92 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  45.92 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  42.06 
 
 		 108 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  40.74 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  39.51 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  38.27 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  34.88 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  38.27 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  40.24 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  27.88 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  37.18 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.87 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  26.47 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.58 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.87 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.59 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.97 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  35.53 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.84 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  28.09 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  26.32 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  31.65 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 250 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 249 aa  50.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.36 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>