129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0244 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0244  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0732  major facilitator superfamily MFS_1  68.13 
 
 
398 aa  528  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  56.57 
 
 
399 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0604  major facilitator superfamily MFS_1  53.52 
 
 
393 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0215  major facilitator transporter  51.19 
 
 
382 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3736  major facilitator superfamily MFS_1  51.36 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.0993496 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0167  major facilitator transporter  47.41 
 
 
393 aa  347  1e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162796  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0794  major facilitator transporter  46.79 
 
 
384 aa  330  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0817  major facilitator transporter  46.79 
 
 
384 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0517  major facilitator transporter  51.74 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0433  major facilitator transporter  44.99 
 
 
389 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3105  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
391 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1461  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 
395 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0250  major facilitator transporter  42.15 
 
 
404 aa  279  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1092  major facilitator transporter  43.79 
 
 
394 aa  260  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2770  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
388 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0697  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
379 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12292  integral membrane protein  43.09 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2321  major facilitator transporter  43.44 
 
 
409 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359591  normal  0.15275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1549  major facilitator transporter  40.63 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  40.77 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2778  major facilitator superfamily transporter  41.82 
 
 
398 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851658  normal  0.145835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2495  major facilitator transporter  40.49 
 
 
419 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.533626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0690  major facilitator transporter  35.43 
 
 
415 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  31.25 
 
 
388 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0594  major facilitator transporter  30 
 
 
364 aa  139  7e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00448971  hitchhiker  0.00000771738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
403 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  31.51 
 
 
406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  32.68 
 
 
400 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
392 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  29.43 
 
 
417 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  29.53 
 
 
402 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  29.58 
 
 
386 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  31.94 
 
 
398 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2529  hypothetical protein  29.1 
 
 
387 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4759  major facilitator transporter  28.27 
 
 
402 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3408  major facilitator transporter  28.27 
 
 
402 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  29.08 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2382  hypothetical protein  28.81 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  30.42 
 
 
406 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1766  major facilitator transporter  41.92 
 
 
364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000930556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  30.28 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5351  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.88 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  29.69 
 
 
453 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3567  major facilitator transporter  29.75 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1522  major facilitator transporter  34.98 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.884088  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  29.48 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  28.73 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  29.2 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  30.46 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  29.97 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
400 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6535  major facilitator transporter  28.84 
 
 
402 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_709  permease of the major facilitator superfamily  27.35 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.768296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  28.69 
 
 
393 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  31.37 
 
 
393 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3368  major facilitator transporter  30.4 
 
 
404 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3000  major facilitator superfamily transporter  29.05 
 
 
397 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5349  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  28.76 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  27.17 
 
 
376 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  27.81 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  27.52 
 
 
399 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  28.97 
 
 
386 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1003  major facilitator transporter  40.49 
 
 
370 aa  106  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  26.94 
 
 
418 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1271  major facilitator transporter  30.83 
 
 
403 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.879022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0566  major facilitator transporter  29.57 
 
 
415 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  27.65 
 
 
404 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
386 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  27.86 
 
 
396 aa  100  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  26.47 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3382  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2894  multidrug-efflux transporter  29.1 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595534  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1563  major facilitator superfamily protein  29.03 
 
 
402 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1824  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000433141  normal  0.0989924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0362  major facilitator transporter  28.73 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1780  major facilitator transporter  25.37 
 
 
397 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0054  major facilitator transporter  28.49 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07690  major facilitator family transporter  27.84 
 
 
404 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.632803  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6139  major facilitator superfamily permease  26.33 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0287  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  28.08 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0026  major facilitator transporter  26.94 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  28.62 
 
 
402 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5671  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  0.329972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1922  major facilitator transporter  27.61 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.356092  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0014  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00955698  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4721  major facilitator transporter  29.41 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2237  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000171112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0455  hypothetical protein  26.05 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  27.02 
 
 
404 aa  76.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0616  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4341  major facilitator transporter  27.24 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00631729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>