More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1388 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
390 aa  775    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  70.26 
 
 
390 aa  568  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  51.92 
 
 
398 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  50.27 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  47.55 
 
 
394 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  44.56 
 
 
391 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  40.66 
 
 
392 aa  302  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  40.47 
 
 
374 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  40.85 
 
 
402 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  39.19 
 
 
419 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.48 
 
 
388 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  39.55 
 
 
386 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  39.39 
 
 
378 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  38.95 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 
384 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.36 
 
 
404 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  37.64 
 
 
404 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  37.36 
 
 
404 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  39.68 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  39.34 
 
 
391 aa  252  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  40 
 
 
395 aa  248  9e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  38.9 
 
 
381 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  38.46 
 
 
378 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  37.05 
 
 
389 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  36.88 
 
 
371 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  37.6 
 
 
386 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 
384 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  36.83 
 
 
370 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  37.94 
 
 
381 aa  219  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  35.9 
 
 
387 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  35.64 
 
 
405 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 
376 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  34.67 
 
 
383 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 
369 aa  214  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  34.78 
 
 
372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  36.99 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  35.58 
 
 
385 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  35.07 
 
 
372 aa  209  8e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  35.2 
 
 
375 aa  209  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.16 
 
 
369 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.16 
 
 
369 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  36.54 
 
 
396 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  38.66 
 
 
397 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 
387 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.88 
 
 
369 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  34.75 
 
 
392 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.82 
 
 
371 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  36.2 
 
 
370 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.55 
 
 
371 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 
372 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.29 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.34 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  36.69 
 
 
395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.24 
 
 
370 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  31.42 
 
 
380 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
376 aa  186  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  34.42 
 
 
393 aa  184  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
373 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  31.89 
 
 
396 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
382 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 
388 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  35.25 
 
 
382 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 
383 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.4 
 
 
399 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  35.96 
 
 
400 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  36.9 
 
 
401 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  36.9 
 
 
401 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  35.2 
 
 
399 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  35.39 
 
 
401 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  35.05 
 
 
386 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  35.05 
 
 
386 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
376 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 
376 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 
373 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  34.44 
 
 
386 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.92 
 
 
399 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 
393 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 
399 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 
382 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  33.73 
 
 
375 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 
376 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 
381 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
381 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  36.72 
 
 
393 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.24 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  34.07 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
377 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
397 aa  146  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
371 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  35.63 
 
 
336 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 
373 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 
398 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
379 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.81 
 
 
376 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 
389 aa  143  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 
373 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 
378 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
381 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>