237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4351 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4351  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  969    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.646589  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3268  hypothetical protein  41.67 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000411591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2059  protein of unknown function DUF112 transmembrane  38.98 
 
 		 497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1910  hypothetical protein  38.74 
 
 		 653 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0703624  normal  0.185536 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3579  hypothetical protein  39.7 
 
 		 648 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0356555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2448  hypothetical protein  34.4 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1159  hypothetical protein  37.68 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0589561  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0165  hypothetical protein  37.88 
 
 		 649 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0500  hypothetical protein  33.2 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  34.89 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.66 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3198  hypothetical protein  34.75 
 
 		 500 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.088206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0830  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.6 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3162  hypothetical protein  34.34 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4219  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.6 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2075  protein of unknown function DUF112 transmembrane  37.3 
 
 		 497 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5724  hypothetical protein  35.83 
 
 		 506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438284  normal  0.286089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  33 
 
 		 519 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.8 
 
 		 536 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  31.87 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  37.11 
 
 		 496 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.88 
 
 		 519 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1067  hypothetical protein  33.27 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  32.12 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0338  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.08 
 
 		 506 aa  248  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.55 
 
 		 503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  32.23 
 
 		 504 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4286  hypothetical protein  33.41 
 
 		 497 aa  246  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3049  hypothetical protein  35.32 
 
 		 504 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235521  normal  0.409974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  35.25 
 
 		 531 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2300  hypothetical protein  33.69 
 
 		 482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.704493  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3714  hypothetical protein  31.27 
 
 		 539 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  31.26 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  33.41 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  33.4 
 
 		 502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03719  conserved hypothetical protein  33.63 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03668  hypothetical protein  33.63 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  33.47 
 
 		 504 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4209  integral membrane protein  33.63 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000736829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3911  hypothetical protein  33.87 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.144759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  33.7 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  31.08 
 
 		 513 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3966  hypothetical protein  31.18 
 
 		 497 aa  237  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2227  hypothetical protein  34.89 
 
 		 504 aa  237  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2439  hypothetical protein  31.45 
 
 		 494 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.48 
 
 		 501 aa  236  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2158  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.14 
 
 		 516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3009  hypothetical protein  30.84 
 
 		 499 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587046  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0598  hypothetical protein  29.98 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5627  tricarboxylate transport protein (TctA)  34.14 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0245667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02416  hypothetical protein  30.51 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2377  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.11 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2024  hypothetical protein  35.29 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482328  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  33.07 
 
 		 515 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003382  putative tricarboxylic transport TctA  31.37 
 
 		 508 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  31.2 
 
 		 505 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.4 
 
 		 536 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1211  hypothetical protein  31.93 
 
 		 506 aa  233  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0374344  normal  0.144663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2223  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.32 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  32 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  32.26 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  32.83 
 
 		 500 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3430  hypothetical protein  34.51 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.467097  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  30.75 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  30.75 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  30.75 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  34.16 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  30.75 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  32.68 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1753  hypothetical protein  30.56 
 
 		 504 aa  230  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0278889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.24 
 
 		 504 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  30.75 
 
 		 506 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0243  hypothetical protein  34.82 
 
 		 508 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  34.38 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  30.75 
 
 		 506 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0093  protein of unknown function DUF112 transmembrane  31.74 
 
 		 500 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4415  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.15 
 
 		 503 aa  229  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2001  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.82 
 
 		 514 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.25 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.98 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0289  hypothetical protein  33.26 
 
 		 499 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1999  protein of unknown function DUF112 transmembrane  33.19 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  32.6 
 
 		 503 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0300  protein of unknown function DUF112 transmembrane  34.45 
 
 		 491 aa  226  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  33.4 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  32.24 
 
 		 505 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  30.41 
 
 		 500 aa  226  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1851  hypothetical protein  35.94 
 
 		 499 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4220  hypothetical protein  32.26 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  32.09 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3049  hypothetical protein  32.21 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  32.27 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36170  hypothetical protein  34.21 
 
 		 506 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3100  hypothetical protein  34.01 
 
 		 509 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0948  hypothetical protein  30.22 
 
 		 509 aa  223  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3083  hypothetical protein  33.99 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  31.86 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  32.55 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4539  hypothetical protein  29.96 
 
 		 497 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3409  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  35.4 
 
 		 498 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>