More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2802 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  90.17 
 
 		 295 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  58.7 
 
 		 294 aa  329  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  60 
 
 		 290 aa  325  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  57.78 
 
 		 296 aa  301  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  52.36 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  56.34 
 
 		 323 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  54.74 
 
 		 294 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  54.38 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  52.82 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  48.74 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  41.97 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  42.27 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  44.22 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  44.22 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  44.22 
 
 		 275 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  46.36 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  45.61 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  44.26 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  43.57 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  41.7 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  39.72 
 
 		 275 aa  195  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  45.96 
 
 		 321 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  44.59 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  43.84 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  40.75 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  37.83 
 
 		 278 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  36.59 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  42.8 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  42.53 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  41.08 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  42.79 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  36.14 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  38.43 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.92 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  34.26 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  34.88 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  38.14 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  33.06 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.44 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.45 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.1 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.74 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.04 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  34.44 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.62 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  33.62 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.62 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.28 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.11 
 
 		 751 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  33.18 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  32.11 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  27.72 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.62 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.35 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  31.15 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  31.15 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  35.03 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  26.24 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  31.76 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  30.93 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4543  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.517654  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.51 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.51 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>