More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2250 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  82.29 
 
 		 616 aa  957    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 600 aa  1219    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 582 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.85 
 
 		 582 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.83 
 
 		 581 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 587 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 		 566 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 571 aa  349  7e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 543 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 550 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 552 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 545 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 536 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.87 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 552 aa  198  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.86 
 
 		 591 aa  190  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 573 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.56 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 546 aa  187  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.51 
 
 		 502 aa  181  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 582 aa  181  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.74 
 
 		 517 aa  177  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.8 
 
 		 495 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.39 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.14 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.6 
 
 		 585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.93 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.25 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  28.21 
 
 		 545 aa  173  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 603 aa  173  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 531 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 567 aa  170  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 574 aa  170  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.35 
 
 		 499 aa  169  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.86 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.59 
 
 		 512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 542 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5324  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.11 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575956  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.47 
 
 		 567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.52 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.63 
 
 		 500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 577 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.63 
 
 		 500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 639 aa  164  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.03 
 
 		 513 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.14 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.3 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  25.25 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.41 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.29 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 548 aa  161  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.18 
 
 		 605 aa  161  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 595 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.75 
 
 		 509 aa  161  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.8 
 
 		 509 aa  160  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.17 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03315  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.02 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.01 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 579 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.86 
 
 		 513 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.56 
 
 		 500 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.62 
 
 		 489 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.21 
 
 		 503 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.76 
 
 		 526 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.98 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.94 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 575 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.96 
 
 		 514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.94 
 
 		 573 aa  157  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.68 
 
 		 557 aa  157  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.41 
 
 		 512 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0630  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.03 
 
 		 531 aa  157  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.25 
 
 		 504 aa  156  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.74 
 
 		 512 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.36 
 
 		 507 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.16 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.18 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 		 504 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.4 
 
 		 525 aa  156  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 573 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.41 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 568 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.01 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 534 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>