More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0322 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  100 
 
 
302 aa  597  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  69.76 
 
 
309 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  67.35 
 
 
305 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  69.07 
 
 
302 aa  391  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  64.24 
 
 
309 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  65.54 
 
 
307 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  65.29 
 
 
300 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  64.09 
 
 
306 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  65.62 
 
 
308 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  63.16 
 
 
308 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  62.84 
 
 
298 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  61.17 
 
 
311 aa  364  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  64.93 
 
 
316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  63.23 
 
 
308 aa  359  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  63.48 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  61.3 
 
 
302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.29 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  61.64 
 
 
302 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  63.27 
 
 
305 aa  352  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  54.98 
 
 
298 aa  352  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  62.89 
 
 
312 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  61.11 
 
 
306 aa  348  8e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  59.27 
 
 
340 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  60.14 
 
 
308 aa  345  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  59.31 
 
 
306 aa  339  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  56.19 
 
 
328 aa  338  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  58.7 
 
 
299 aa  338  9e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  59.66 
 
 
297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  53.33 
 
 
302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  56.95 
 
 
317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  58.36 
 
 
313 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  58.36 
 
 
313 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  58.36 
 
 
313 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  57.68 
 
 
301 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.66 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.13 
 
 
324 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  57.39 
 
 
300 aa  316  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.33 
 
 
317 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.49 
 
 
302 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  58.42 
 
 
300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  57.34 
 
 
247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  51.55 
 
 
307 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  51.55 
 
 
307 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  51.06 
 
 
304 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  51.2 
 
 
307 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
304 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  36.39 
 
 
300 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  40.27 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  36.91 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  33.11 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  41.72 
 
 
304 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  39.46 
 
 
307 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  32.66 
 
 
314 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  37.29 
 
 
307 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
297 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
297 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  34.38 
 
 
297 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 
306 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
390 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.49 
 
 
291 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.8 
 
 
290 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  41.16 
 
 
301 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  32.56 
 
 
293 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
305 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  38.26 
 
 
327 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  31.89 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.67 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  37.55 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.53 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.53 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.66 
 
 
293 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.73 
 
 
326 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
313 aa  165  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.01 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  37.79 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  36.88 
 
 
304 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  26.49 
 
 
295 aa  161  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  40.79 
 
 
334 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  34.65 
 
 
303 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
309 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  37.38 
 
 
747 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.62 
 
 
319 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  34.23 
 
 
313 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  35.41 
 
 
313 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>